瀋陽解放後，江星辰、林格澤兩大集羣分路向北推進。長春守將鐵良見大勢已去，只得於7月17日率全體清軍投降。至1912年8月上旬，東北三省除日軍佔據的遼東半島以外全部解放，清朝滅亡。
與此同時，中日關係也日益惡化。兩軍空戰後，雙方更是劍拔弩張，臨戰氣氛空前濃烈。日本政府既不甘心就此屈服，又懾於中德聯盟及解放軍軍力，始終不能做出最後決斷。一面向中國政府提出強烈抗議，一面致函英國，依據早先簽定的日英軍事盟約，要求其聯合協約國各方，對已徹底倒向同盟國陣營的中國採取果斷措施。對此，以英、法、俄爲首的協約國集團內部，生出了一種較爲微妙的關係。
這要從早先辜鴻銘出使聖彼得堡說起，這次訪問促成了《中俄北滿問題條約》的簽定，切實保障了俄國在中國東北的巨大利益，俄國沙皇也有意與中方聯合遏制在亞洲與其有根本利益衝突的日本，自然對此反應冷淡。
對英法兩國而言，英國在東海海戰中已經損失了其遠東艦隊主力，法國則更關心近在咫尺的德軍威脅，均難以抽調出大批軍力赴遠東軍事幹涉。簡單地說，最有能力幹涉遠東事務的俄國態度曖昧，而最熱衷於幫助日本的英法兩國，卻是心有餘而力不足。
形勢發展到這個階段，中日之間要不要開戰？以何種方式開戰？這是擺在日本最高當局面前最沉重的抉擇。對此，東京的主戰、主和兩派分歧日益嚴重。爭吵的結果是，主張爲謀求徹底勝利，而不惜對中國進行全面戰爭的朝鮮總督寺內正毅大將被調職。這位山縣有朋元老最忠實的追隨者，若幹年後在他的回憶錄《大和落日》中寫道：“我和我屬下的15萬官兵都深信，只要得到命令，我們完全有可能在關東一舉擊潰中國軍隊。然而後來的事實證明了我的觀點是錯誤的，即使當時我們發動了這樣一次進攻，我們付出的代價也將遠遠超過我們所能獲得的好處”
很顯然，在這場交鋒中能否獲得勝利已經不是一個簡單的軍事問題，而是政治和經濟問題，是值不值得的問題了。首先，大敵德國當前，英法等國出兵的可能性幾乎爲零。在英法愛莫能助的前提下，東京的有識之士們看到，單憑日本國力來謀求勝利顯然是一件不合算的生意。中國在關東地區雖然只動用了五分之一軍隊，但是增加一至兩倍兵力是完全沒有問題的；然而日本增加兵力就不那麼容易了。在沒有取得絕對制海權的情況下，不論是經由海路投放兵力，還是脆弱的後勤補給線，都無法得到保障；更不用說中國擁有的絕對制空權了。且不說戰爭勝負難料，即便勝了這場戰爭，日本也必定傾盡了國力。接下來面對着毫髮無損的俄羅斯帝國，中日雙方也只能落得個鷸蚌相爭、漁翁得利的下場。西方強國中，也只有俄羅斯才能在遠東逐鹿中擁有得天獨厚的地理優勢。這一點正是日俄矛盾的根本所在。
所以從政治的眼光看，儘量不將敵人逼進絕境，維持短暫的和平無疑是明智的。中國雖然殲滅了日本空軍，但這畢竟是日軍飛機越界在先，人家在自家領空擊落入侵敵機嚴格來說算不上正式開戰。對國家初定的中國來說，和日本打一場曠日持久的戰爭，顯然也是不明智的。因此，日本高層相信，在中國領導人眼裏，和平也同樣不失爲明智的選擇。而現在雙方等待的，不過是一個可以體面解決的機會。
但是這時，中日雙方都陷入了一種尷尬境地，雖然都有和談的意願，但雙方都認爲由己方提出會有失體面從而在談判中處於不利境地，就在雙方似乎都處於進退兩難的時候，中方預先佈設的和談契機出現了。
1912年8月12日，俄國外交部遠東司發表聲明：“俄羅斯希望滿洲危機能夠和平解決，如中日雙方有意締結和平條約，俄羅斯認爲這對雙方來說都是非常明智的決定。”
同時指出：“和平談判應在雙方野戰軍司令之間進行，不涉及政治、領土等原則問題，談判內容僅限於純軍事範疇內。”
這個提議非常巧妙地迴避了矛盾，將和談侷限於軍事領域，從而暫時擱置下中日雙方的原則衝突。中國政府在第一時間就明確表示同意，日本當局經過慎重考慮後，也決定參加和談，向關東總督大島義昌中將下達了準備和談的指令。
大島義昌受命後，向駐節於營口的中方最高指揮官王嘯飛發出了通知，提議中日兩軍解除對峙，各自沿實際控制線後撤5公裏，將普蘭店一帶劃爲非軍事區，舉行第一次會談，得到了中方的同意。
8月25日上午，第一次正式會談舉行，中方首席代表爲解放軍第二野戰軍參謀長姜政，日方是關東軍參謀長小泉一郎，俄國外交部遠東司長卡察科夫以調停方代表身份出席。
小泉首先拋出了3條提案：1中方應認可日軍在遼東半島的事實存在2中方應認可南滿鐵路租借權及其他既得權益3賠償日軍機損失。
姜政當即反駁道：日方所提的都是政治問題，超出本代表的權限，是不能討論的內容，同時提出了簡潔的回應提案：除認可日軍在遼東半島上的軍事存在外，中國不承認日本在中國國內一切權益，並拒絕承擔一切賠償。
中方的提案看上去和日方相距甚遠，實則是在日方心理預期中的。這種和平談判其實與生意場上的談判沒有什麼兩樣，一方儘可以漫天要價，另一方也可以就地還錢，但兩方都會有一個不可退讓的底線，這個底線如果相差不大，達成一致的機會就很大，如果底線相差很大，就不可能達成一致。
中日矛盾的焦點無非是兩條：1日本實際控制下的中國遼東半島2中國實際控制下的日本權益。既然雙方都不願以戰爭解決，那麼最實際的解決方案不外乎你控制你的，我控制我的。簡單地說就是互相認可其實際控制區域。從這個角度來說，中方的提案是最接近雙方底線的。
經過激烈的討價還價，中日雙方最終於9月底達成了和解協議。雙方承諾，在不改變各自原則立場的前提下，維持現有的軍事控制區；日本政府及日本國民在中國東北開設之企業、機構和不動產，全部交中方接管，人員由中方護送出境，中方給予日本政府經濟補償白銀300萬兩，分10年支付。
局勢穩定後，王嘯飛向石錚提出，中日矛盾根深蒂固，來日必定會有一場大戰，以東三省至關重要的戰略地位，現有兵力尤恐不足，建議在東北地區就地徵兵30萬。石錚對此深以爲然，但考慮到軍費緊張，不宜大舉擴軍，指示王嘯飛，可從主力部隊中抽調人員組建成三個教導旅，先期訓練30萬民兵，藏軍於民，以備來日之需。王嘯飛受命後，把編練東北新軍的工作交由江星辰負責。
東北問題解決後，西藏問題隨之迎刃而解。早在共和革命初期，南京政府就派員赴拉薩與西藏地方接洽，要求其與清朝脫離關係。但當時國內局勢複雜，地方當局態度曖昧。直到東北解放的消息傳到拉薩，方纔明確了立場，決定併入共和國版圖。
共和國政府一如元、明、清三朝，繼續冊封達賴喇嘛、班禪額爾德尼兩大活佛，使其獲得在西藏地方的政治、宗教上的合法地位。同時建立西藏藏族自治區的行政區劃，在拉薩設置自治區政府，自治區主席由西藏地方提名，中央政府批準。同時設立西藏民族事務公署，委派專員行使中央職權。基本上沿襲了清朝對西藏事務的管理制度。
至此，中國大定。